特別な話では無いのですが、設定方法を忘れてしまってあたふたしたので備忘録として記載。
ライブラリソース内デバッグとかを行う際、Resource is out of sync with the file systemのエラーがEclipseから出てしまい、その対処方法です。
[Windows]->[Preferences]で設定ダイアログを表示します。
この画面通り、チェックを付与すればOKですね。
※Eclipse 3.5系が中心で作業しているので、以降は違う箇所とかに変更されているかもしれません。(^^;
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